用primer-blast检测引物的时候 为什么比对结果中出现要扩增基因的mRNA序列?用cDNA设计的隐物

来源:学生作业帮助网 编辑:作业帮 时间:2024/04/30 14:58:26

用primer-blast检测引物的时候 为什么比对结果中出现要扩增基因的mRNA序列?用cDNA设计的隐物
用primer-blast检测引物的时候 为什么比对结果中出现要扩增基因的mRNA序列?
用cDNA设计的隐物

用primer-blast检测引物的时候 为什么比对结果中出现要扩增基因的mRNA序列?用cDNA设计的隐物
根据mRNA(真核的)设计的引物,一般如果用DNA做模板的话,那么会出现的情况会是以下几种.一是能扩增出条带,但目标条带比你要的条带要大,因为你会连同内含子一同扩增出来,所以片段会偏大.二是什么都扩增不出来,这种情况一般是两种原因,1个是内含子片段太大,taq聚合酶没有延伸完,这种情况是很常见的,真核生物的基因组DNA编码序列中的内含子一般都很大.还有一种原因是你设计的引物正好是跨了内含子的序列,也就是说你的引物序列设计的时候位于两个外显子之间,这样的情况是扩增不出东西的.不过这种情况很少,因为一般设计的引物长度约20bp,而且位于序列的最两边,在最两边的这么少数碱基中出现内含子的可能性很小.最后一种情况是扩增出正好和你目标序列差不多的片段,原因是基因组DNA中有一些序列是没有内含子的,典型的就是线粒体和叶绿体DNA,这些DNA更接近于原核生物,编码的基因是没有内含子的.

用primer-blast检测引物的时候 为什么比对结果中出现要扩增基因的mRNA序列?用cDNA设计的隐物 (生物信息学)用NCBI primer-blast设计引物的 时候“misprimed product”是啥意思NCBI primer-blast的数据库构建是什么原理呢? primer 与BLAST 设计引物哪个好?设计引物遇到点问题,用primer 设计的引物,特异性不好.而用BLAST设计的引物又无法了解引物的一些特性.哪个更好呢?不知道用primer可不可以检测BLAST设计的引物的特 用ncbi中primer-blast设计的引物怎么不告诉我有不有引物二聚体? 怎样用primer-blast设计引物 BLAST设计引物的问题?原来用Primer5.0设计引物,但是效果一直都不好,怀疑特异性不强,现在改用BLAST设计引物:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/,但是在这一步,,我不知道如何选择参数,我是做 荧光定量PCR引物设计本人在做荧光定量PCR之前,先用Primer 3.0设计了目的基因的引物,用于半定量PCR,而且也把引物放入NCBI中进行了blast比对,得到引物为特异性引物,半定量PCR效果也跟预期一样,电 用primer 5.0 设计引物的时候,哪个才是真正的PCR产物退火温度Tm,看哪个? BLAST引物特异性检测 ,中间细线代表什么,是不是中间有细线的越多越好? tm值与退火温度[求助]我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些相关参数?我想进行引物的特异性检验,进入primer-blast,怎么设置一些参数?结果如何分析?直接在序列框中输入上空 如何用blast检测引物序列结果好不好 逆转录PCR引物,在PUBMED上搜文献上找了一个引物,BLAST了一下,结果如下,但是自己不大会分析,求指导~BLAST(前2张图)和Primer-BLAST(最后一张)结果如下:不知道这样的结果特异性好不好,能不能 pp5引物设计用PRIMER自动搜索设计的多对引物中,能不能用一对引物的上游与另一对引物的下游配对 相同的引物在Primer Premier 5和Primer Premier 6里面检测,各个参数(如退火温度)基本都不一样,为什么如题,相同的引物在Primer Premier 5.0和Primer Premier 6.0里面检测,各个参数(如退火温度)基本都不 如何使用primer premier设计RETN、ISG20的引物 求引物设计软件,Primer primer,Oligo, 怎么用primer express3.0设计实时荧光定量PCR引物,能不能提供具体的操作流程 引物设计,用PRIMER 5 设计引物时,有的mRNA设计出来的引物序列,即使最高分的那对,也有二聚体或交叉,该怎么调整,或怎么设计这种mRNA的引物序列.