perl分析基因序列就是给出一个.fa类型的文件,找出其中的N长度,GC长度,GC比例等信息.

来源：学生作业帮助网 编辑：作业帮 时间：2024/05/12 14:07:25

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perl分析基因序列
就是给出一个.fa类型的文件,找出其中的N长度,GC长度,GC比例等信息.

perl分析基因序列就是给出一个.fa类型的文件,找出其中的N长度,GC长度,GC比例等信息.
#!/usr/bin/perl -w
use strict;
open my $fhin,$ARGV[0];
my ($seq,$g,$c);
while(my $line = ){
chomp($line);
$seq .= $line;
print $line;
$g += () = $line m/[Gg]/g;
$c += () = $line m/[Cc]/g;
}
my $length = length($seq);
print "Sequence length is:".$length."\nContains ".$g." Gs and ".$c." Cs\nGC percentage is:".(($g+$c)/$length).".\n";

perl分析基因序列就是给出一个.fa类型的文件,找出其中的N长度,GC长度,GC比例等信息. 如何利用生物信息学分析一个基因的DNA序列 我想找一个基因序列进行分析,我该去哪找? 基因序列比较怎么分析? 如何查找基因序列分析软件 分子生物学中分析基因序列怎么分析 根据基因序列,推断出氨基酸序列如题!给出了一下的DNA序列,求出完整的氨基酸序列!CAGGAGACCGACAGCCAGCAGCACACGCAG就是上面这个DNA序列,然后要求写出完整的氨基酸序列,重赏跪谢! 怎么用NCBI查找一个基因的序列,希望能给出我详细的步骤, 生物信息学基因序列分析!明天要交啊!就是开放阅读框,BLAST等等... 什么是16S rDNA基因序列分析 怎样分析基因序列比对结果 写一个随机DNA序列 100bp用的是PERL 怎么从genbank中找序列我现在在做一个生物的基因序列分析,需要从GENBANK中找一些别的相似基因做对比. 怎么下载AUG上游500bp和下游500bp的基因序列?线虫物种,所有基因.那位大仙帮我指点指点,perl语言实现 核苷酸序列转换蛋白质序列已知一个基因的核苷酸序列,如何将它转变成蛋白质序列? 如何查找一个基因的特异性序列和保守型序列? 有两个fastaq格式的DNA序列文件,想写一个perl程序完成!有两个fastaq格式的DNA序列文件,想同时把每个文件中每组断片的两端精度小于10的基因删除,之后再将每组平均精度低于30的断片删除,想写一 氨基酸序列分析,ncbi上哪里可以分析一段基因序列哪一段是内含子?